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Text File  |  1994-09-19  |  2KB  |  38 lines
  1.        Document 0408
  2.  DOCN  M9490408
  3.  TI    Analysis of a rape case by direct sequencing of the human
  4.        immunodeficiency virus type 1 pol and gag genes.
  5.  DT    9411
  6.  AU    Albert J; Wahlberg J; Leitner T; Escanilla D; Uhlen M; Department of
  7.        Clinical Virology, Swedish Institute for Infectious; Disease Control,
  8.        Karolinska Institute, Stockholm.
  9.  SO    J Virol. 1994 Sep;68(9):5918-24. Unique Identifier : AIDSLINE
  10.        MED/94335109
  11.  AB    Transmission of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) from a male
  12.        accused of rape and deliberate transmission of HIV-1 was investigated by
  13.        sequencing of the HIV-1 pol and gag genes from virus obtained from the
  14.        male and from the female victim. Parts of the reverse transcriptase and
  15.        p17gag genes were amplified and directly sequenced from uncultured
  16.        peripheral blood mononuclear cells. The sequences were compared with
  17.        sequences from 21 unrelated HIV-1-infected controls from the same
  18.        geographic area (Stockholm, Sweden). Bootstrap analysis of phylogenetic
  19.        trees demonstrated that the sequences from the female were significantly
  20.        more closely related to the sequences from the male than to sequences
  21.        from the controls. Furthermore, we found that the male and female shared
  22.        two distinct genetic variants of HIV-1. In p17gag the major variant had
  23.        an unusual, out-of-frame deletion of 3 nucleotides which the minor
  24.        variant lacked. These results indicated that the male had transmitted
  25.        more than one infectious unit to the female. From this study we
  26.        concluded that it was highly likely that the HIV-1 strains carried by
  27.        the male and female were closely epidemiologically linked.
  28.  DE    Base Sequence  Comparative Study  Drug Resistance, Microbial  DNA
  29.        Primers/CHEMISTRY  Female  *Genes, gag  *Genes, pol  Human
  30.        HIV-1/*GENETICS  Male  Molecular Sequence Data  Phylogeny  *Rape
  31.        Reverse Transcriptase/CHEMISTRY  Sequence Alignment  Sequence Homology,
  32.        Amino Acid  Support, Non-U.S. Gov't  Zidovudine/PHARMACOLOGY  JOURNAL
  33.        ARTICLE
  34.  
  35.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  36.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  37.  
  38.